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A.A. 2015-2016

CORSO INTEGRATO DI INFORMATICA E BIOINFORMATICA
per il CLT in BIOLOGIA MOLECOLARE, Scuola di Scienze, Università di Padova

Docenti: Prof. Alessandro Sperduti (Informatica) e Prof. Stefania Bortoluzzi (Bioinformatica)

Info sul corso

Il corso, al II semestre, consistera' in 24 ore di lezione frontale (16+8; 2+1 crediti) e 32 ore di laboratorio (16+16; 1+1 crediti), per un totale di 5 crediti.
Presentazione del Corso

Orario

Calendario Lezioni e Esercitazioni

Esame finale

Verifica scritta
Esempio compito

Programma e materiale didattico

BIOINFORMATICA LEZIONI MATERIALE
La biologia molecolare nell'era dei "big data".
Le metodologie sperimentali high-troughput e la grande disponibilita' di dati sperimentali e conoscenza richiedono approcci quantitativi basati sull'informatica e la statistica per lo studio dei fenomeni biologici.
Diapositive lezioni
Database.
Database di biosequenze, risorse web orientate alla genetica, alla biologia molecolare e alla genomica.
Diapositive lezioni
Lavorare con le sequenze.
Cenni su allineamenti di sequenze.
Diapositive lezioni
Ricerca di similarita'.
Omologia e similarita', BLAST: una breve introduzione.
Diapositive lezioni
INFORMATICA LEZIONI MATERIALE
Architettura degli elaboratori Diapositive lezioni
Sistemi Operativi Diapositive lezioni
Algoritmi Diapositive lezioni
Networking e Internet Diapositive lezioni
Linguaggi di Programmazione: Python Pensare da informatico - Python
INFORMATICA ESERCITAZIONI MATERIALE
I esercitazione Informatica Guida
II esercitazione Informatica Guida
III esercitazione Informatica Guida
IV esercitazione Informatica File processing
Dizionario
Testo
BIOINFORMATICA ESERCITAZIONI MATERIALE
I esercitazione Bioinformatica GUIDA
Verifica
II esercitazione Bioinformatica GUIDA
Verifica
III esercitazione Bioinformatica GUIDA
Verifica
IV esercitazione Bioinformatica GUIDA
Verifica

Contatti

Roberto di Pietro <dipietro@mat.uniroma3.it>
Stefania Bortoluzzi <stefania.bortoluzzi@unipd.it>