A.A. 2014-2015

CORSO INTEGRATO DI INFORMATICA E BIOINFORMATICA
per il CLT in BIOLOGIA MOLECOLARE, Scuola di Scienze, Università di Padova

Docenti: Prof. Roberto di Pietro (Informatica) e Dr. Stefania Bortoluzzi (Bioinformatica)

Il corso, al II semestre, consistera' in 24 ore di lezione frontale (16+8; 2+1 crediti) e 32 ore di laboratorio (16+16; 1+1 crediti), per un totale di 5 crediti.
Presentazione del Corso Verifica scritta
Esiti Esami 23 giugno 2015 e 7 luglio 2015

BIOINFORMATICA	LEZIONI	MATERIALE
	La biologia molecolare nell'era dei "big data". Le metodologie sperimentali high-troughput e la grande disponibilita' di dati sperimentali e conoscenza richiedono approcci quantitativi basati sull'informatica e la statistica per lo studio dei fenomeni biologici.	Diapositive lezioni
	Database. Database di biosequenze, risorse web orientate alla genetica, alla biologia molecolare e alla genomica.	Diapositive lezioni
	Lavorare con le sequenze. Allineamenti, cenni sugli algoritmi di allineamento locale e globale, omologia e similarita', BLAST.	Diapositive lezioni
	Navigare i genomi. Risorse NCBI, UCSC Genome Browser, ENSEMBL, ENCODE.	Diapositive lezioni
INFORMATICA	LEZIONI	MATERIALE
	Architettura degli elaboratori.	Diapositive lezioni
	Circuiti logici, rappresentazione dell'informazione.	Diapositive lezioni Diapositive lezioni Diapositive lezioni
	Sistemi operativi, database. Reti di elaboratori, sicurezza.	Diapositive lezioni Diapositive lezioni
	Networking	Diapositive lezioni
	Linguaggio Python.	Diapositive lezioni Diapositive lezioni Diapositive lezioni Diapositive lezioni
INFORMATICA	ESERCITAZIONI	MATERIALE
	I esercitazione Informatica	Guida
	II esercitazione Informatica	Guida
	III esercitazione Informatica	Guida Solutions
	IV esercitazione Informatica	File processing Void Function Definition
BIOINFORMATICA	ESERCITAZIONI	MATERIALE
	I esercitazione Bioinformatica	GUIDA Verifica
	II esercitazione Bioinformatica	GUIDA Verifica
	III esercitazione Bioinformatica	GUIDA Verifica
	IV esercitazione Bioinformatica	GUIDA

Roberto di Pietro <dipietro@mat.uniroma3.it>
Stefania Bortoluzzi <stefania.bortoluzzi@unipd.it>