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A.A. 2013-2014

CORSO INTEGRATO DI INFORMATICA E BIOINFORMATICA
per il CLT in BIOLOGIA MOLECOLARE, Scuola di Scienze, Università di Padova

Docenti: Dr. Mauro Conti (Informatica) e Dr. Stefania Bortoluzzi (Bioinformatica)

Info sul corso

Il corso, al II semestre, consistera' in 24 ore di lezione frontale (16+8; 2+1 crediti) e 32 ore di laboratorio (16+16; 1+1 crediti), per un totale di 5 crediti.
Presentazione del Corso

Orario

Orario e aule per lezioni e esercitazioni

Esame finale

Verifica scritta
Risultati Appello 17 giugno 2014
Risultati Appello Bioinfo 1 luglio 2014
Risultati Appello Bioinfo 15 luglio 2014
Risultati Appello Bioinfo 5 settembre 2014

Programma e materiale didattico

BIOINFORMATICA LEZIONI MATERIALE
La biologia molecolare nell'era dei "big data".
Le metodologie sperimentali high-troughput e la grande disponibilita' di dati sperimentali e conoscenza richiedono approcci quantitativi basati sull'informatica e la statistica per lo studio dei fenomeni biologici.
Diapositive lezioni
Database.
Database di biosequenze, risorse web orientate alla genetica, alla biologia molecolare e alla genomica.
Diapositive lezioni
Lavorare con le sequenze.
Allineamenti, cenni sugli algoritmi di allineamento locale e globale, omologia e similarita', BLAST.
Diapositive lezioni
Navigare i genomi.
Risorse NCBI, UCSC Genome Browser, ENSEMBL, ENCODE.
Diapositive lezioni
INFORMATICA LEZIONI MATERIALE
Architettura degli elaboratori. Diapositive lezioni
Circuiti logici, rappresentazione dell'informazione. Diapositive lezioni
Diapositive lezioni
Diapositive lezioni
Sistemi operativi, database.
Reti di elaboratori, sicurezza.
Diapositive lezioni
Diapositive lezioni
Networking Diapositive lezioni
Linguaggio Python. Diapositive lezioni
Diapositive lezioni
Diapositive lezioni
Diapositive lezioni
INFORMATICA ESERCITAZIONI MATERIALE
I esercitazione Informatica Guida
II esercitazione Informatica Guida
III esercitazione Informatica Guida
Solutions
IV esercitazione Informatica File processing
Void Function Definition
BIOINFORMATICA ESERCITAZIONI MATERIALE
I esercitazione Bioinformatica GUIDA
II esercitazione Bioinformatica GUIDA
III esercitazione Bioinformaticao GUIDA
IV esercitazione Bioinformatica GUIDA

Contatti

Mauro Conti <mauro.conti@unipd.it>
Stefania Bortoluzzi <stefania.bortoluzzi@unipd.it>