A.A. 2011-2012
CORSO DI BIOINFORMATICA per il CLT in Biotecnologie Sanitarie, Università di Padova
Docente: Dr. STEFANIA BORTOLUZZI
Course Info
Final Exam Info
Esami
Program and Teaching material
| ORE | ARGOMENTO | MATERIALE |
| LEZIONI | ||
| 4 | Database. Cenni su struttura e funzionamento, database di biosequenze, risorse web orientate alla genetica, alla biologia molecolare ed alla genomica, database di proteine. | |
| 4 | Lavorare con le sequenze. Allineamenti, algoritmi di allineamento locale e globale, omologia e similarita', BLAST. | |
| 4 | Navigare i genomi. NCBI Map View, UCSC Genome Browser, ENSEMBL, VEGA, UCSC BLAT. | |
| 4 | Introduzione all'analisi di dati d'espressione genica. Profili e matrici d'espressione; ricerca di geni co-espressi e di geni differenzialmente espressi. | |
| ESERCITAZIONI | ||
| 4 | Database e data retrieval; dalla malattia al gene. | I esercitazione |
| 4 | Ricostruzione della filogenesi di una famiglia proteica. | II esercitazione |
| 4 | Caratterizzazione della struttura genomica di un gene ed analisi del promotore. | III esercitazione |
| 4 | Analisi del trascrittoma in organismi modello a partire da dati di deep sequencing: mappaggio al genoma ed analisi dei risultati per l'identificazione di geni espressi. | IV esercitazione |