A.A. 2009-2010
CORSO DI BIOINFORMATICA per il CLT in Biotecnologie Sanitarie, Università di Padova
Docente: Dr. STEFANIA BORTOLUZZI
Course Info
Final Exam Info
Program and Teaching material
| ORE | ARGOMENTO | MATERIALE |
| LEZIONI | ||
| 4 | Database. Cenni su struttura e funzionamento, database di biosequenze, risorse web orientate alla genetica, alla biologia molecolare ed alla genomica, database di proteine. | |
| 4 | Lavorare con le sequenze. Allineamenti, algoritmi di allineamento locale e globale, omologia e similarita', BLAST. | |
| 4 | Navigare i genomi. NCBI Map View, UCSC Genome Browser, ENSEMBL, VEGA, UCSC BLAT. | |
| 4 | Introduzione all'analisi di dati d'espressione genica. Profili e matrici d'espressione; ricerca di geni co-espressi e di geni differenzialmente espressi. | |
| ESERCITAZIONI | ||
| 4 | Database e data retrieval. | I esercitazione |
| 4 | Dalla malattia al gene. | II esercitazione |
| 4 | Ricostruzione della filogenesi di una famiglia proteica. | III esercitazione |
| 4 | Caratterizzazione della struttura genomica di un gene ed analisi del promotore. | IV esercitazione |