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A.A. 2009-2010

CORSO DI BIOINFORMATICA
per il CLT in Biotecnologie Sanitarie, Università di Padova

Docente: Dr. STEFANIA BORTOLUZZI

Course Info

Il corso, al II semestre, verra' svolto in 32 ore, comprendenti lezioni teoriche frontali ed esercitazioni al computer.
Presentazione del Corso

Final Exam Info

Verifica scritta. Appello di fine corso (11 giugno 2010)

Program and Teaching material

ORE ARGOMENTO MATERIALE
LEZIONI
4 Database. Cenni su struttura e funzionamento, database di biosequenze, risorse web orientate alla genetica, alla biologia molecolare ed alla genomica, database di proteine.
4 Lavorare con le sequenze. Allineamenti, algoritmi di allineamento locale e globale, omologia e similarita', BLAST.
4 Navigare i genomi. NCBI Map View, UCSC Genome Browser, ENSEMBL, VEGA, UCSC BLAT.
4 Introduzione all'analisi di dati d'espressione genica. Profili e matrici d'espressione; ricerca di geni co-espressi e di geni differenzialmente espressi.
ESERCITAZIONI
4 Database e data retrieval. I esercitazione
4 Dalla malattia al gene. II esercitazione
4 Ricostruzione della filogenesi di una famiglia proteica. III esercitazione
4 Caratterizzazione della struttura genomica di un gene ed analisi del promotore. IV esercitazione

Contact

Stefania Bortoluzzi <stefibo@bio.unipd.it>